公司成立于1991年5月1日，由吉林延边自治州国营中大公司负责人为主发起创立，最初的名称是“安图天马有限责任公司”， 第二年根据易经天圆地方原理改名为“安图方圆有限责任公司”。租用了吉林省安图县亮兵台镇一个僻静山沟里闲置的军用战备库，生产饲料酵母菌，同年9月，引进了父母代海兰白蛋种鸡，向延吉市销售种雏和鸡蛋。1992年4月，公司又开发出以鸡肉为原料的精气神补膳和风味鸡系列产品，获得了中国医疗保健国际交流促进会金奖。
1993年年底，在永吉成立了永吉方圆有限公司，买下了永吉县西阳镇太阳沟8272兵工厂，经过修缮改造，饲养父母代肉种鸡和生产精气神补膳、风味鸡产品。
1995年，总部迁往长春，注册了吉林省方圆有限公司，租赁了长春市示范奶牛场牛舍，在这里改造建立了父母代肉种鸡孵化厂，随后又建立了商业饲料厂。
1998年租赁了长春市粮食集团年产十万吨饲料厂，孵化厂迁回永吉县西阳镇太阳沟8272兵工厂，同时退出了长春示范奶牛场。“精气神”牌畜禽系列饲料连续荣获“中国饲料行业信得过产品”、“吉林省消费者满意产品”、“吉林省质量信得过产品”等称号。并且通过了中国质量认证中心（CQC）9001：2000国际质量管理体系和国际质量认证联盟（IQNET）双认证。产品销往东北、华北、西北等地区。
1998年6月3日，经吉林省政府体改委批准，成立了吉林方圆实业股份有限公司，为保持公司名称与注册商标的一致性，2001年更名为“吉林精气神实业股份有限公司”。
1998年，公司开始研发山黑猪产业项目。先后在吉林珲春市四道沟和敦化市黄泥河进行山黑猪牧养试验。 通过品尝、检测山黑猪的各项指标明显优于工厂化圈养白猪。因此公司决定开发山黑猪项目。在永吉县西阳镇太阳沟8272兵工厂建立了山黑猪种猪场，陆续引进了北京黑猪、松辽黑猪、青岛黑猪、东北民猪、苏太黑猪、大约克猪等优良种猪。
2003，租赁了长春市食品集团双阳区齐家镇占地17万平方米、建筑面积3万6千平方米的闲置猪场，建立了山黑种猪猪繁育基地，并在永吉县及蛟河市逐步建起了山黑猪商品代养殖基地。
2003年5月，山黑猪产品开始进入北京市场，成立了北京精气神有机食品有限公司，随后产品打入天津各大商超；2003年7月，“精气神”山黑猪产品通过了欧盟（ECOCERT）有机食品认证，成为中国首家通过欧盟有机食品认证的企业；2004年11月，“精气神”山黑猪产品通过了长白山生态食品认证；山黑猪项目被吉林省政府列为振兴东北老工业基地项目。
2005年，公司被吉林省政府列为“农业产业化龙头企业”。连续六年被评为“吉林省重合同守信用企业”。
2006年，山黑猪产品进入上海、深圳市场，有机山黑猪产品又通过了中绿华夏（COFCC）有机食品认证；
2007年3月，公司产业定位为专营有机食品产业，将常规饲料产业项目转给吉林方圆饲料有限公司经营。
2007年5月，通过了欧盟、美国（BCS）有机食品认证。
2007年5月17日，经吉林省工商管理局批准，更名为吉林精气神有机农业股份有限公司。
2008年3月在山黑猪产业基地——永吉县注册成立了全资子公司“永吉精气神有机农业有限公司。
精气神有机农业股份有限公司：
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